《通知》要求，省屬公立醫院人員經費占總支出的比例原則上不得超過45%（專科醫院原則上不得超過50%）。以市（州）為單位，甘孜、阿壩、涼山三州公立醫院人員經費占總支出的總體比例原則上不得超過50%（專科醫院原則上不得超過55%）；其他市公立醫院人員經費占總支出的總體比例原則上不得超過45%（專科醫院原則上不得超過50%）。各市（州）可對轄區內各公立醫院分別確定具體比例。

        醫院要嚴格控制管理費用支出，管理經費占總支出的比例不得超過15%。特殊情況下，由醫院統一管理的離退休經費占管理費用支出的比例達到60%及以上的，管理經費占總支出的比例不得超過20%。

        《通知》規定，醫院年終按業務收支結余待分配額的60%提取事業基金，專門用于醫院事業發展及彌補虧損。對于事業基金滾存較多的醫院，在編制年度預算時應安排一定數量的事業基金；醫院年終按業務收支結余待分配額的10%提取職工福利基金，專門用于職工集體福利設施和集體福利待遇。職工福利基金結余較多的醫院，可以適當降低提取比例或暫停提取，相應降低或暫停提取的部分劃入事業基金。醫院年終按業務收支結余待分配額的30%提取獎勵基金，主要用于醫院人員考核獎勵。同級人力資源和社會保障、財政部門結合單位公益目標完成情況、績效考核結果、獎勵基金計提情況等，合理調整公立醫院績效工資總量。