磷酸氯喹片主要用于治療對氯喹敏感的惡性瘧、間日瘧及三日瘧。并可用于瘧疾癥狀的抑制性預防。也可用于治療腸外阿米巴病、結締 組織病、光敏感性疾病（如日曬紅斑）等。

在國家藥品監督管理局網站查詢，磷酸氯喹片共有30個批準文號。根據米內網數據顯示，2018年，磷酸氯喹片在中國城市公立醫院、縣級公立醫院的銷售總額約為人民幣170萬元。