1949年前后，我軍秘密派遣1500余名干部入臺。50年代初，由于叛徒出賣，地下黨組織遭受破壞，被國民黨當局公審處決1100余人。主要叛徒就是蔡孝乾，他是長征中唯一的臺灣籍共產黨人。1945年9月蔡孝乾被任命為中共臺灣工委書記，1946年7月秘密返臺開展工作。

    1950年1月蔡孝乾被國民黨逮捕入獄，供出蔡的是臺灣工委委員陳澤民。蔡第一次被捕后尋機逃脫，但3個月后再次被捕，很快即變節，使1800多人被捕入獄。蔡孝乾叛變后加入國民黨，后升任該室少將副主任兼“司法行政部調查局副局長”。1982年10月，蔡孝乾在臺灣病死。

    蔡孝乾叛變后，供出了時任“國防部”參謀次長的吳石、以及陳寶倉、聶曦、朱諶之(朱楓)等，這就是轟動兩岸的“吳石案”。1950年6月10日吳石將軍副官聶曦就義前留影，他曾協助朱諶之離臺。

    1950年6月10日吳石將軍副官聶曦上校就義后遺照。臺灣方面稱“聶曦形象英武，大義凜然，死前毫無懼色。” 此圖已成為白色恐怖歷史的經典影像

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