臨床上，有不少甲減患者反映自己關節疼痛、肌肉酸脹，更有甚者擔心這些是不是治療無效的表現。

一旦人體缺少甲狀腺激素，就會影響神經、心血管、消化和骨關節等多個系統。甲減患者關節疼痛，主要是因為肌肉、骨骼關節中缺少甲狀腺激素，導致組織新陳代謝降低、產熱下降、蛋白質合成減少，引起肌肉無力。

另外，甲狀腺激素減少，還會導致組織間黏蛋白增多、鈉鉀代謝紊亂，導致患者出現暫時性肌強直、痙攣、疼痛，甚至重癥肌無力。

由于關節疼痛、肌肉乏力，有些甲減患者不敢鍛煉，這是不對的。其實，甲減患者在接受治療的同時加強鍛煉，例如每天進行20~60分鐘有氧運動，對肌肉乏力、僵硬有很好的緩解作用。如果患者關節疼痛較嚴重，就要避免使用跑步機、固定式自行車等運動。相比而言，游泳可減緩關節受到的壓力，是理想的低強度有氧運動。此外，力量或負荷訓練可增強肌肉質量、靜息代謝率，有助于保護關節。蹲起、弓步和抬腿等運動也都是好的選擇。